24 мая 2016 г. в городе Астана прошло второе заседание Президиума Делового совета Евразийского экономического союза. В целях повышения эффективности работы Делового совета создан исполнительный орган и введена должность Президента Делового совета Союза, сформирован рабочий секретариат. На должность Президента Делового совета членами Президиума Делового совета единогласно утверждена кандидатура Виктора Борисовича Христенко, который в недавнем прошлом являлся Председателем Коллегии Евразийской экономической комиссии.  Для регламентации внесенных изменений и закрепления функциональных обязанностей Президента Делового совета в уставных документах подписано Соглашение о создании Делового совета Евразийского экономического союза с изменениями и дополнениями (редакция 2016 года). Стороны Делового совета также подписали Меморандум о взаимодействии с Евразийской экономической комиссией.

Президиумом Делового совета принято решение активизировать работу представителей бизнеса в 19 консультативных комитетах, созданных при Евразийской экономической комиссии. Каждая из сторон Делового совета должна делегировать своих экспертов в состав консультативных комитетов.
Помимо организационных вопросов в соответствии с Повесткой дня заседания заслушан отчет Евразийского центра интеграционных исследований и коммуникаций (Секретариат Делового совета) о результатах исполнения Протокола первого заседания Президиума Делового совета и рассмотрены вопросы:
о роли бизнеса в формировании торговой политики ЕАЭС;
о роли интеграции в развитии предпринимательства в рамках ЕАЭС (анализ барьеров и возможностей бизнеса в  процессах интеграции);
об обеспечении транзита в рамках ЕАЭС;
о перспективах и экономических выгодах для бизнеса при реализации проекта ЕАЭС – экономический пояс «шелкового пути»;о ходе работы над проектом Таможенного кодекса ЕАЭС;
о совершенствовании механизмов работы суда ЕАЭС;
о формирование единого розничного платежного пространства в рамках ЕАЭС.
Президиумом Делового совета принято обращение к Совету Евразийской экономической комиссии (на уровне вице-премьеров) в связи с систематически возникающими проблемами при транзите грузов по территории Российской Федерации, включенных в «санкционный» список.